Pinkeltje is een klein mannetje, zo groot als je pink. Hij heeft een witte baard en een blauwe puntmuts, maar hij is geen kabouter! Op een dag komt Pinkeltje in een storm terecht en raakt zijn huis kwijt. Op een blad wordt hij meegevoerd door de wind en komt uiteindelijk, na een nacht in een ooievaarsnest en bij een mollenfamilie, heel ver weg in een straat terecht. Een muis, Knabbel, ziet hem en neemt hem mee naar Het Grote Huis.

In Het Grote Huis gaat Pinkeltje bij de muizenfamilie wonen en raakt daar bevriend met de muizen Knabbel, Grijshuid, Zwartsnoet, Kraaloog en Langstaart. Naast de muizen raakt Pinkeltje ook bevriend met de poes Snorrebaard en de hond Wiebelstaart.

Pinkeltje beleeft in Het Grote Huis allemaal verschillende avonturen. Zo belandt hij in de neus van een sneeuwpop en heeft hij ruzie met Wipstaart, de kraai. Elk hoofdstuk is weer een nieuw avontuur.

Daarnaast helpt Pinkeltje de familie die in Het Grote Huis woont stiekem, want zij mogen hem niet zien. Hij legt bijvoorbeeld de naald terug die de moeder kwijt was geraakt. Of hij zorgt ervoor dat het jongetje geen koekjes pikt.